Танкист. Полковник. Родился в селе Протопоповка Арзамасского района. Перед призывом в армию работал в слесарно-механических мастерских. В первую мировую войну был солдатом, а затем подпрапорщиком на турецком фронте. Участник гражданской войны Окончил Военную академию им.М.В.Фрунзе в 1929, академические курсы усовершенствования офицеров.

В июне 1941 г. ушел на фронт. Его танковая, позднее механизированная бригада громила врага под Москвой, Воронежем, форсировала Днепр, Вислу, Одер. Бригада И.С. Ваганова в составе танковой армии генерала Рыбалко первой с юго-востока ворвалась в фашистскую столицу и, сломив сопротивление врага, вышла на подступы к рейхстагу. В разгар боев за Берлин Ваганов был контужен, временно потерял зрение, но продолжал командовать соединением. А через несколько дней его бригада стремительно продвигалась к восставшей Праге. Ваганов на своем танке первым вступил на северо-западную окраину столицы Чехословакии.

    Указом Президиума Верховного Совета СССР от 31 мая 1945г. Ивану Семеновичу Ваганову было присвоено звание Героя Советского Союза.

     После войны И.С. Ваганов возвратился в академию им. М.В. Фрунзе, где работал преподавателем. В 1954 г. он кандидат военных наук, доцент. С 1958 г. – пенсионер Министерства обороны. Был Почетным гражданином г. Брандиса-на-Лабе. Его именем назван парк этого города.